Neben den B.A.-Studiengängen bietet die Folkwang drei verschiedene Masterstudiengänge an, die entweder rein wissenschaftlich (1-Fach-Master) oder als Kombination aus wissenschaftlichen und künstlerischen Anteilen (2-Fach-Master) studiert werden können:
Die erste Studienrichtung (Historische Musikwissenschaft) wendet sich an Studierende mit einem verstärkten musikgeschichtlichen Interesse. Ziel des Studiums ist eine vertiefte Auseinandersetzung mit allen Facetten der Historischen Musikwissenschaft (bspw. Werk- und Gattungsgeschichte, Notation und Edition). In der zweiten Studienrichtung (Musik- und Kulturwissenschaft) werden verstärkt die kulturellen Kontexte von Musik behandelt, etwa auch mit Blick auf musikethnologische Fragestellungen. Der dritte Schwerpunkt (Konzert- und Musiktheaterdramaturgie) zielt auf die Vermittlung dramaturgischer Kenntnisse ab und beinhaltet daher eine vertiefte Auseinandersetzung mit der Theorie und Geschichte des Musiktheaters.
Unabhängig vom Schwerpunkt sind in allen Studiengängen berufsbezogene Veranstaltungen (etwa zum Kulturmanagement) sowie ein Praktikum vorgesehen. Dadurch, dass jede dieser drei Studienrichtung sowohl als 1-Fach- als auch als 2-Fach-Master in Kombination mit einem künstlerischen Fach studiert werden kann, steht eine breite Auswahl zur Verfügung, die je nach Interessen der Bewerber*innen für unterschiedliche Berufsfelder qualifiziert.